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《实用免疫细胞与核酸》附录四 实验室常用技术参数资料

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一、核酸及蛋白质常用数据

1.

化合物分子量λmax(pH7.0)1摩尔溶液(pH7.0)中λmax时的最大吸收值OD280/OD260ATP507259154000.15CTP48327190000.97GTP523253137000.66UTP484262100000.38dATP494259152000.15dCTP46727193000.98dGTP507253137000.66dTTP48226796000.71

2.常用核酸的长度与分子

核酸核苷酸数分子量λDNA48502(双链环状)3.0×107pBR3224363(双链)2.8×10628SrRNA48001.6×10623SrRNA37001.2×10618SrRNA19006.1×10519SrRNA17005.5×1055SrRNA1203.6×104tRNA(大肠杆菌)752.5×104

3.常用核酸蛋白换算数据

(1)重量换算

1μg=10-6g  1pg=10-12g

1ng=10-9g  1fg=10-15g

(2)分光光度换算:

1A260双链DNA=50μg/ml

1A260单链DNA=30μg/ml

1A260单链RNA=40μg/ml

(3)DNA摩尔换算:

1μg 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端

1μg pBR322 DNA=0.36pmol

1pmol 1000bp DNA=0.66μg

1pmol pBR322=2.8μg

1kb双链DNA(钠盐)=6.6×105道尔顿

1kb单链DNA(钠盐)=3.3×105道尔顿

1kb单链RNA(钠盐)=3.4×105道尔顿

(4)蛋白摩尔换算:

100pmol分子量100,000蛋白质=10μg

100pmol分子量50,000蛋白质=5μg

100pmol分子量10,000蛋白质=1μg

氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿

(5)蛋白质/DNA换算:

1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7×104MW蛋白质

10,000MW蛋白质=270bp DNA

30,000MW蛋白质=810bp DNA

50,000MW蛋白质=1.35kb

100,000MW蛋白质=2.7kb DNA

4.常用蛋白质分子量标准参照

(1)高分子量标准参照(2)中分子量标准参照(3)低分子量标准参照肌球蛋白分子量磷酸化酶B97,400碳酸酐酶31,00肌球蛋白212,000牛血清白蛋白66,200大豆脻蛋白酶21,500β-半乳糖甘酶B116,000谷氨酶脱氢酶55,000抑制剂 磷酸化酶B97,400卵白蛋白42,700马心肌球蛋白16,900牛血清白蛋白66,200醛缩酶40,000溶菌酶14,400过氧化氢酶`57,000碳酸酐酶31,000肌球蛋白(F1)8,100醛缩酶40,000大豆脻蛋白酶21,500肌球蛋白(F2)6,200  抑制剂 肌球蛋白(F3)2,500  溶菌酶14,400  

5.常用DNA分子量标准参照

λDNA/HindⅢλDNA/EcoRⅠλ/HindⅢ+EcoRⅠpBR322/HaeⅢ23130212262122758712394167421514840510465575804497350489436156434268458802322484335304346420273530202726757564 190423451125 158421321  137519218  97418411  8311247  564    125  

续上表

pBR322/HinfⅠφχ174/HinfⅠφχ174/Hae Ⅲφχ174/TapⅠ1631726140135329145177131181078117550655310087240439650082603327344417663102312984134828114122131142271872202494023454154200241943375151 11820   72 

二、常用缓冲液

1.分子克隆常用缓冲液

2.磷酸缓冲液

(1)25℃下0.1mol/L磷酸钾缓冲液的配制※

pH1mol/L K2HPO4(ml)1mol/L KH2PO4(ml)5.88.591.56.013.286.86.219.280.86.427.872.26.638.161.96.849.750.37.061.538.57.271.728.37.480.219.87.686.613.47.890.89.28.094.06.2

(2)25℃下0.1mol/L磷酸钠缓冲液的配制※

pH1mol/L Na2HPO4(ml)1mol/L NaH2PO4(ml)5.87.992.16.012.088.06.217.882.26.425.574.56.635.264.86.846.353.77.057.742.37.268.431.67.477.422.67.684.515.57.889.610.48.093.26.8

※:用蒸馏水将混合的两种1mol/L贮存液稀释至1000ml,根据Henderson-Hasselbalch方程计算其pH值:

pH=pK’+1g([质子受体]/[质子供体])

在此,pK’=6.86(25℃)。

3.电泳缓冲液

测序凝胶加样缓冲液

98%去离子甲酰胺

10mol/L EDTA(pH8.0)

0.025%二甲苯青FF

0.025%溴酚蓝

甲酰胺:许多批号的试剂级甲酰胺,其纯度符合使用要求,无须再进行处理。不过,一旦略呈黄色,则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与Dowex XG8混合床树脂共同搅拌1小时进行去离子处理,并用Whatman 1号滤纸过滤2次,去离子甲酰胺分装成小份,充氮存于-70℃。

常用的电泳缓冲液

缓冲液使用液浓贮存液(每升)Tris-乙酸(TAE)1×:0.04mol/L Tris-乙酸50×:242gTris碱 0.001mol/L EDTA57.1ml冰乙酸  100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)Tris-磷酸(TPE)1×:0.09mol/L Tris-磷酸10×:10gTris碱 0.002mol/L EDTA15.5ml85%磷酸(1.679g/ml)  40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)Tris-硼酸(TBE)a0.5×0.045mol/L Tris-硼酸5×:54gTris碱 0.001mol/L EDTA27.5硼酸  20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)碱性缓冲液b1×:50mmol/L NaOH1×:5ml 10mol/L NaOH 1mmol/L EDTA2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)Tris-甘氨酸c1×:25mmol/L Tris5×:15.1gTris 250mmol/L 甘氨酸94g苷氨酸(电泳级)(pH8.3) 0.1% SDS50ml 10% SDS(电泳级)

说明:

①TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5×溶液,出现沉淀后则予以废弃。

以片都以1×TBE作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5×的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。

进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小, 故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1×TBE以提供足够的缓冲容量。

②碱性电泳缓冲液应现用现配。

③Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。

2×SDS凝胶加样缓冲液:

100mmol/L Tris·HCl(6.8)

200mmol/L二硫苏糖醇(DTT)

4%SDS(电泳级)

0.2%溴酚蓝

20%甘油

不含DTT的2×SDS凝胶加样缓冲液可保存于室温,应在临用前取1mol/L贮存液现加于上述缓冲液中。

4.凝胶加样缓冲液

缓冲液类型6×缓冲液贮存温度Ⅰ0.25%溴酚蓝4℃0.25%二甲苯青FF40%(W/V)蔗糖水溶液Ⅱ0.25溴酚蓝室温0.25%二甲苯青FF15%聚蔗糖(Ficoll400)Ⅲ0.25%溴酚蓝4℃0.25%二甲苯青FF30%甘油水溶液Ⅳ0.25%溴酚蓝4℃40%(W/V)蔗糖水溶液碱性加样缓冲液:300mmol/L NaOH6mmol/L EDTAⅤ18%聚蔗糖(Ficoll400)4℃0.15%溴甲酚绿0.25%二甲苯青FF

使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三:增大样品密度;以确保DNA均匀进入样品孔内;使样品呈现颜色,从而使加样操作更为便利,含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的染料。溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青FF的2.2倍,而与琼脂糖浓度无关。以0.5×TBF作电泳液时,溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状DNA相同,而二甲苯青FF的泳动则与长4kb的双链线状DNA相同。在琼脂糖浓度为0.5%~1.4%的范围内,这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显著。

选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。但是,对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪染料,因为在碱性pH条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。

5.各种pH值的Tris缓冲液的配制

各种pH值的Tris缓冲液的配制所需pH值(25℃)0.1mol/L HCl的体积7.145.77.244.77.343.47.442.07.540.37.638.57.736.67.834.57.932.08.029.28.126.28.222.98.319.98.417.28.514.78.612.48.710.38.88.58.97.0

某一特定pH值的0.05mol/LTris缓冲液的配制:将50ml 0.1mol/L Tris碱溶液与上表所示相应体积(单位:ml)的0.1ml/L HCl混合,加水将体积调至100ml

(2)温度对50mmol/LTris·HCl液pH值的影响

4℃25℃37℃8.17.57.28.27.67.38.37.77.48.47.87.58.57.97.68.68.07.78.78.17.88.88.27.98.98.38.09.08.48.19.18.58.29.28.68.39.38.78.49.48.88.5

(6)常用缓冲液的pKa值

缓冲液分子量pKa值缓冲范围Trisa12.18.087.1~7.9HEPESb283.37.477.2~8.2MPOSc209.37.156.6~7.8PIPESd304.36.766.2~7.3MESe195.26.095.4~6.8

a:三羟甲基氨基甲烷;b:N-2-羟乙基哌嗪-N’-2-乙磷酸;c:3-(N-吗啉代)丙磺酸;d:N,N’-双(2-乙磺酸)哌嗪;e:2-(N-吗啉代)乙磺酸。

7.温度对常用缓冲液pH的影响

缓冲体系pKa(20℃)△pKa/10℃Mes6.15-0.110Ada6.60-0.110PiPes6.80-0.085Aces6.90-0.200Bes7.15-0.160Mops7.20-0.013Tes7.50-0.200Hepes7.55-0.014Tricine8.15-0.210Tris8.30-0.310Bicine8.35-0.180Glycylglycine8.40-0.280

三、常用酶的配制

1.溶菌酶

用水配制成50mg/ml的溶菌酶溶液,分装成小份并保存于-20℃。每一小份一经使用后便予丢弃。

2.蛋白水解酶

 贮存液贮存温度反应浓度反应缓冲液温度预处理0.01mol/L Tris(pH7.8)链霉蛋白酶a20mg/ml-20℃(溶于水)1mg/ml0.01mol/L EDTA37℃自消化b0.5% SDS0.01mol/L Tris(pH7.8)蛋白酶Kc20mg/ml-20℃(溶于水)50μg/ml0.005mol/L EDTA37~56℃无须预处理0.5% SDS

a:链霉蛋白酶是从链球菌(Streptomycesgriseus)中分离到的一种丝氨酸酶和酸性蛋白酶的混合物。

b:自消化可消除DNA酶和RNA酶的污染,经自消化的链酶蛋白酶的配制方法如下:把该酶的粉末溶解于10mmol./lTris·HCl(pH7.5)、10mmol/l NaCl中,配成20mg/ml浓度,于37℃温育1h。经消化的链霉蛋白酶分装成小份放在密封试管中,保存-20℃。

c:蛋白酶K是一种枯草蛋白酶类的高活性蛋白酶,从林伯氏白色念球菌(Tritirachium album Limber)中纯化得到。该酶有两个Ca2+结合位点,它们离酶的活性中心有一定距离,与催化机理并无直接关系。然而,如果从该酶中除去Ca2+,由于出现远程的结构变化,催化活性将丧失80%左右,但其剩余活性通常已足以降解在一般情况下污染酸制品的蛋白质。所以,蛋白酶K消化过程中通常加入EDTA(以抑制依赖于Mg2+的核酸酶的作用)。但是,如果要消化对蛋白酶K具有较强耐性的蛋白,如角蛋白一类,则可能需要使用含有1mmol/l Ca2+而不含EDTA的缓冲液。在消化完毕后、纯化核酸前要加入EGT(pH8.0)至终浓度为2mmol/L,以鳌合Ca2+。

3.无DNA酶的RNA酶

将胰RNA酶(RNA酶A)溶于10mmol/l Tris·HCl(pH7.5)、15mmol/l NaCl中,配成10mg/ml的浓度,于100℃加热15min,缓慢冷却至室温,分装成小份保存于-20℃。

四、常用抗生素溶液

抗生素贮存液a工作浓度浓度保存条件严紧型质粒松弛型质粒氨苄青霉素50mg/ml(溶于水)-20℃20μg/ml60μg/ml羧苄青霉素50mg/ml(溶于水)-20℃20μg/ml60μg/ml氯霉素34mg/ml(溶于乙醇)-20℃25μg/ml170μg/ml卡那霉素10mg/ml(溶于水)-20℃10μg/ml50μg/ml链霉素10mg/ml(溶于水)-20℃10μg/ml50μg/ml四环素b5mg/ml(溶于乙醇)-20℃10μg/ml50μg/ml

a:以水为溶剂的抗生素贮存液通过0.22μm滤器过滤除菌。以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。

b:镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB培养基)。

五、常用贮存液的配制

1.30%丙烯酰胺溶液

【配制方法】

将29g丙烯酰胺和1g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。用Nalgene滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温。

【注意】

丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收,其作用具累积性。称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具。可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能会含有少量未聚合材料。

一些价格较低的丙烯酰胺和双丙烯酰胺通常含有一些金属离子,在丙烯酰胺贮存液中加入大约0.2体积的单床混合树脂(MB-1Mallinckrodt),搅拌过夜,然后用Whatman 1号滤纸过滤以纯化之。

在贮存期间,丙烯酰胺和双丙烯酰胺会缓慢转化成丙烯酰和双丙烯酸。

2.40%丙烯酰胺

【配制方法】

把380g丙烯酰胺(DNA测序级)和20g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为600ml的蒸馏水中。继续按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法处理,但加热溶解后应以蒸馏水补足至终体积为1L。

【注意】

见上述配制30%丙烯酰胺的说明,40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列测定。

3.放线菌素D溶液

【配制方法】

把20mg放线菌素D溶解于4ml 100%乙醇中,1:10稀释贮存液,用100%乙醇作空白对照读取OD440值。放线菌素D(分子量为1255)纯品在水溶液中的摩尔消化系数为21,900,故而1mg/ml的放线菌素D溶液在440nm处的吸光值为0.182,放线菌素D的贮存液应放在包有箔片的试管中,保存于-20℃。

【注意】

放线菌素D是致畸剂和致癌剂,配制该溶液时必须戴手套并在通风橱内操作,而不能在开放在实验桌面上进行,谨防吸入药粉或让其接触到眼睛或皮肤。

药厂提供的作治疗用途的放线菌素D制品常含有糖或盐等添加剂。只要通过测量贮存液在440nm波长处的光吸收确定放线菌素D的浓度,这类制品便可用于抑制自身引导作用。

4.0.1mol/L腺苷三磷酸(ATP)溶液

【配制方法】

在0.8ml水中溶解60mgATP,用0.1mol/L NaOH调至pH值至7.0,用蒸馏水定容1ml,分装成小份保存于-70℃

5.10mol/L乙酸酰溶液

【配制方法】

把770g乙酸酰溶解于800ml水中,加水定容至1L后过滤除菌。

6.10%过硫酸铵溶液

【配制方法】

把1g过硫酸铵溶解于终量为10ml的水溶液中,该溶液可在4℃保存数周。

7.BCIP溶液

【配制方法】

把0.5g的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸二钠盐(BCIP)溶解于10ml 100%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃

8.2×BES缓冲盐溶液

【配制方法】

用总体积90ml的蒸馏水溶解1.07g盐溶液BES[N,N-双(2-羟乙基)-2-氨基乙磺酸]、1.6g NaCl和0.027g Na2HPO4,室温下用HCl调节 该溶液的pH值至6.96、然后加入蒸馏水定容至100ml,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成小份,保存于-20℃。

9.1mol/L CaCl2溶液

【配制方法】

在200ml蒸馏水中溶解54gCaCl2·6H2O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成10ml小份贮存于-20℃。

【注意】

制备感受态细胞时,取出一小份解冻并用蒸馏水稀释至100ml,用Nalgene滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,然后骤冷至0℃。

10.2.5mol/L CaCl2溶液

【配制方法】

在20ml蒸馏水中溶解13.5gCaCl2·6H2O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。

11.1mol/L二硫苏糖醇(DTT)溶液

【配制方法】

用20ml 0.01mol/L乙酸钠溶液(pH5.2)溶解3.09g DTT,过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。

【注意】

DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。

12.脱氧核苷三磷酸(dNTP)溶液

【配制方法】

把每一种dNTP溶解于水至浓度各为100mmol/L左右,用微量移液器吸取0.05mol/l Tris碱分别调节 每一dNTP溶液的pH值7.0(用pH试纸检测),把中和后的每种dNTP溶液各取一份作适当稀释,在下表中给出的波长下读取光密度计算出每种dNTP的实际浓度,然后用水稀释成终浓度为50mmol/L的dNTP,分装成小份贮存于-70℃。

碱基波长(nm)消化系数(ε)[L/(mol·cm)]A2591.54×104G2531.37×104C2719.10×103T2607.40×103

比色杯光径为1cm时,吸光度=εM

13.0.5mol/l EDTA(pH8.0)溶液

【配制方法】

在800ml水中加入186.1g二水乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na·2H2O),在磁力搅拌器上剧烈搅拌,用NaOH调节 溶液的pH值至8.0(约需20g NaOH颗粒)然后定容至1L,分装后高压灭菌备用。

【注意】

EDTA二钠盐需加入NaOH将溶液的pH值调至接近8.0,才能完全溶解。

14.溴化乙锭(10mg/ml溶液)

【配制方法】

在100ml水中加入1g溴化乙锭,磁力搅拌数小时以确保其完全溶解,然后用铝箔包裹容器或转移至棕色瓶中,保存于室温。

【注意】

小心:溴化乙锭是强诱变剂并有中度毒性,使用含有这种染料的溶液时务必戴上手套,称量染料时要戴面罩。

15.2×HEPES缓冲盐溶液

【配制方法】

用总量为90ml的蒸馏水溶解1.6g NaCl、0.074g KCl、0.027g Na2PO4·2H2O、0.2g葡聚糖和1gHEPES,用0.5mol/lNaOH调节 pH值至7.05,再用蒸馏水定容至100ml。用0.22μm滤器过滤除菌,分装成5ml小份,贮存于-20℃。

16.IPTG溶液

【配制方法】

IPTG为异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(分子量为238.3),在8ml蒸馏水中溶解2g IPTG后,用蒸馏水定容至10ml,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。

17.1mol/L乙酸镁溶液

【配制方法】

在800ml水中溶解214.46g四水乙酸镁,用水定容至1L过滤除菌。

18.1mol/L MgCl2溶液

【配制方法】

在800ml水中溶解203.4gMgCl2·6H2O,用水定容至1L,分装成小份并高压灭菌备用。

【注意】

MgCl2极易潮解,应选购小瓶(如100g)试剂,启用新瓶后勿长期存放。

19.β-巯基乙醇(BME)溶液

【配制方法】

一般得到的是14.4mol/L溶液,应装在棕色瓶中保存于4℃。

【注意】

BME或含有BME的溶液不能高压处理。

20.NBT溶液

【配制方法】

把0.5g氯化氮蓝四唑溶解于10ml 70%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃。

21.酚/氯仿溶液

【配制方法】

把酚和氯仿等体积混合后用0.1mol/L Tris·HCl(pH7.6)抽提几次以平衡这一混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆盖等体积的0.01mol/l Tris·HCl(pH7.6)液层,保存于4℃。

【注意】

酚腐蚀性很强,并可引起严重灼伤,操作时应戴手套及防护镜,穿防护服。所有操作均应在化学通风橱中进行。与酚接触过的部位皮肤应用大量的水清洗,并用肥皂和水洗涤,忌用乙醇。

22.10mmol/L苯甲基磺酰氟(PMSF)溶液

【配制方法】

用异丙醇溶解PMSF成1.74mg/ml(10mmol/L),分装成小份贮存于-20℃。如有必要可配成浓度高达17.4mg/ml的贮存液(100mmol/L)。

【注意】

PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤,吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。一旦眼睛或皮肤接触了PMSF,应立即用大量水冲洗之。凡被PMSF污染的衣物应予丢弃。

PMSF在水溶液中不稳定。应在使用前从贮存液中现用现加于裂解缓冲液中。PMSF在水溶液中的活性丧失速率随pH值的升高而加快,且25℃的失活速率高于4℃。pH值为8.0时,20μmmol/l PMSF水溶液的半寿期大约为85min,这表明将PMSF溶液调节 为碱性(pH>8.6)并在室温放置数小时后,可安全地予以丢弃。

23.磷酸盐缓冲溶液(PBS)溶液

【配制方法】

在800ml蒸馏水中溶解8gNaCl、0.2g KCl、1.44g Na2HPO4和0.24g KH2PO4,用HCl调节 溶液的pH值至7.4加水定容至1L,在15lbf/in2(1034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min。保存于室温。

24.1mol/L乙酸钾(pH7.5)溶液

【配制方法】

将9.82g乙酸钾溶解于90ml纯水中,用2mol/L乙酸调节 pH值至7.5后加入纯水定容到1L,保存于-20℃。

25.乙酸钾溶液(用于碱裂解)

【配制方法】

在60ml 5mol/L乙酸钾溶液中加入11.5ml冰乙酸和28.5ml水,即成钾浓度为3mol/L而乙酸根浓度为5mol/L的溶液。

26.3mol/L乙酸钠(pH5.2和pH7.0)溶液

【配制方法】

在80ml水中溶解408.1g三水乙酸钠,用冰乙酸调节 pH值至5.2或用稀乙酸调节 pH值至7.0,加水定容到1L,分装后高压灭菌。

27.5mol/L NaCl溶液

【配制方法】

在800ml水中溶解292.2gNaCl加水定容至1L,分装后高压灭菌。

28.10%十二烷基硫酸钠(SDS)溶液

【配制方法】

在900ml水中溶解100g电泳级SDS,加热至68℃助溶,加入几滴浓盐酸调节 溶液的pH值至7.2,加水定容至1L,分装备用。

【注意】

SDS的微细晶粒易扩散,因此称量时要戴面罩,称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS,10%SDS溶液无须灭菌。

29.20×SSC溶液

【配制方法】

在800ml水中溶解175.3gNaCl和88.2g柠檬酸钠,加入数滴10mol/l NaOH溶液调节 pH值至7.0,加水定容至1L,分装后高压灭菌。

30.20×SSPE溶液

【配制方法】

在800ml水中溶解17.5gNaCl、27.6g NaH2PO4·H2O和7.4g EDTA,用NaOH溶液调节 pH值至7.4(约需6.5ml 10ml/L NaOH),加水定容至1L,分装后高压灭菌。

31.100%三氯乙酸溶液

【配制方法】

在装有500g TCA的瓶中加入227ml水,形成的溶液含有100%(M/V)TCA。

32.1mol/L Tris溶液

【配制方法】

在800ml水中溶解121.91gTris碱,加入浓HCl调节 pH值至所需值。

pH HCl

7.4 70ml

7.6 60ml

8.0 42ml

应使溶液冷至室温后方可最后调定pH值,加水定容至1L,分装后高压灭菌。

【注意】

如1mol/L溶液呈现黄色,应予丢弃并置备质量更好的Tris。

尽管多种类型的电极均不能准确测量Tris溶液的pH值,但仍可向大多数厂商购得合适的电极。

Tris溶液的pH值因温度而异,温度每升高1℃,pH值大约降低0.03个单位。例如:0.05mol/L的溶液在5℃、25℃、和37℃时的pH值分别为9.5、8.9和8.6。

33.Tris缓冲盐溶液(TBS)(25mmol/l Tris)

【配制方法】

在800ml蒸馏水中溶解8gNaCl、0.2g KCl和3g Tris碱,加入0.015g酚并用HCl调至pH值至7.4,用蒸馏水定容至1L,分装后在151bf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸汽灭菌20min,于室温保存。

34.X-gal溶液

【配制方法】

X-gal为5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D半乳糖苷。用二基甲酰胺溶解X-gal配制成的20mg/ml的贮存液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中,装有X-gal溶液的试管须用铝箔封裹以防因受光照而被破坏,并应贮存于-20℃。X-gal溶液无须过滤除菌。

杂交试验中用于降低背景的封闭剂

试剂用途Denhardt试剂Northern杂交使用RNA探针的杂交单拷贝序列的Southern杂交将DNA固定于尼龙膜上的杂交Denhardt试剂通常配制50×贮存液,过滤后保存于-20℃。可将该贮存液10倍稀释于预杂交液(常为含有0.5%SDS和100μg/ml经变性被打断的鲑精DNA的6×SSC或6×SSPE)中。50×Denhardt液中含5g聚蔗糖(Ficoll,400型,Pharmacia)、5g聚乙烯吡咯烷酮和5g牛血清白蛋白(组分V”Sigmal),加水至终体积为500ml。BLOTTOGrunstein-Hogness杂交Benton-Davis杂交除单拷贝序列Southern杂交以外的所有Southern杂交斑点印迹1×BLOTT(牛乳转移技术优化液,Bovine Lacto Transfer Technique Optimizer),是含5%胶脂奶粉和0.02%叠氮钠的水溶液,应保存于4℃。使用前可用预杂交液稀释25倍。BLOTTO不应与高浓度的SDS并用,因为后者会导致牛奶中蛋白质析出。如果杂交背景不合要求,可在杂交液中加入NP-40至终浓度为1%。BLOTTO不能用作Northern杂交的封闭剂,因为这一封闭剂中可能含有RNA酶,其活性之高使人无法接受。注意:叠氮钠有毒性,取用时需戴手套小心操作。含叠氮钠的溶液应予明确标记。肝素Southern杂交原位杂交肝素(Sigma H-7005,从猪中提取的二级产品或相当等级的产品)用4×SSPE或4×SSC溶解配制成50mg/ml的浓度,保存于4℃。肝素在含有葡聚糖硫酸酯的杂交液中用作封闭剂的浓度为500μg/ml,在不含葡聚糖硫酸酯的杂交液中的浓度为50μg/ml。经变性并被打断的鲑精DNAsouthern和Northern杂交把鲑鱼精子DNA(Sigma,Ⅲ,盐钠)溶解于水配制成10mg/ml的浓度,必要时于室温磁力搅拌2~4h助溶。把溶液中NaCl的浓度调至0.1mol/L,并用酚和酚/氯仿各抽提一次,回收水相。合DNA溶液快速通17号皮下注射针头12次,以剪切DNA。加入2倍体积用冰预冷的乙醇沉淀DNA。离心回收DNA并重溶于水,配制成10mg/ml的浓度,测定溶液的OD260值并计算出精确的DNA浓度,然后煮沸10min,分装成小份保存于-20℃。使用前置沸水浴中加热5min,然后迅速在冰浴中骤冷。预杂交液中应含有100μg/ml经变性并被打断的鲑鱼精子DNA

六、常用凝胶的技术参数

1.葡聚糖凝胶的某些技术数

种类干颗粒直径(μ)分子量分级范围床体积毫升/克干分子筛得水值溶胀最少平衡时间(h)柱头压力(kPa)(2.5cm直径柱)肽及球形蛋白质葡聚糖(线性分子)室温沸水浴Sephadex G-1040~ 120~700~7002~ 31.0±0.131 Sephadex G-1040~ 120~150015002.5~3.51.5±3.531 Sephadex G-25        粗级100~300

(≈5~100目)       中级50~150

(≈100~200目)1,000~

5,000100~

5,0004~61.5±0.262 细级20~800(≈200~400目)       超细10~40       Sephadex G-50        粗级100~200       中级50~1501,500~500~     细级20~8030,00010,0009~115.0±0.362 超细10~40       Sephadex G-75         40~1203,000~1,000~     超细10~4070,000950,00012~157.5±0.52433.92~15.86Sephadex G-100         40~1204,000~1,000~     超细10~401,500,000150,00015~2010.0±1.04852.35~9.41Sephadex G-150         40~1205,000~1,000~20~30    超细10~40400,000150,00018~2215.0±1.57250.88~3.53Sephadex G-200         40~1205000~1000~30~40     10~40800,000200,00020~2520.0±2.07250.39~1.57

2.聚丙烯酰胺凝胶的技术数

型号排阻的下限

(分子量)分级分离范围

(分子量)膨胀后的床体积(ml/g干凝胶)膨胀所需最少时间(室温,h)Bio-gel-P-21,600200~2,0003.82~4Bio-gel-P-43,600500~4,0005.82~4Bio-gel-P-64,6001,000~5,0008.82~4Bio-gel-P-1010,0005,000~17,00012.42~4Bio-gel-P-3030,00020,000~50,00014.910~12Bio-gel-P-6060,00030,000~70,00019.010~12Bio-gel-P-100100,00040,000~100,00019.024Bio-gel-P-150150,00050,000~150,00024.024Bio-gel-P-200200,00080,000~200,00034.048Bio-gel-P-300300,000100~400,00040.048

3.琼脂糖凝胶的技术数

型号琼脂糖含量

%(W/W)排阻的下限

(分子量)分级分离的范围(分子量)生产厂家Sepharose 4B4 0.3×106~3×106PharmaciaSepharose 2B2 2×106~25×106Sagavac 10102.5×1051×104~2.5×105SeravacSagavac 887×1052.5×104~7×105Sagavac 662×1065×104~2×106Sagavac 4415×1062×105~15×106Sagavac 22150×1065×105~15×107Bio-gel A-0.5M100.5×106<1×104~0.5×106Bio-RadBio-gel A-1.5M81.5×106<1×104~1.5×106Bio-gel A-5M65×1061×104~5×106Bio-gel A-15M415×1064×104~15×106Bio-gel A-50M250×1061×105~50×106Bio-gel A-150M1150×1061×106~150×106

4.各处凝胶所允许的最大操作

凝胶最大静水压(kPa)Sephadex G-109.8G-159.8G-259.8G-509.8G-754.9

5.琼脂糖凝胶浓度与线性DNA分辨范

凝胶浓度(%)线性DNA长度(bp)0.51000~300000.7800~120001.0500~100001.2400~70001.5200~30002.050~2000

6.染料在变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速

凝胶浓度(%)溴酚蓝二甲苯青FF5.035bp140bp6.026bp106bp8.019bp75bp10.012bp55bp20.08bp28bp

7.染料在非变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速

凝胶浓度(%)溴酚蓝二甲苯青FF3.5100bp460bp5.065bp260bp8.045bp160bp12.020bp70bp15.015bp50bp20.012bp45bp

七、氨基酸的特性

氨基酸名称三字母缩写单字母缩写质量侧链电离的pHa值结构式丙氨酸(alanine)AlaA89.09  精氨酸(arginine)ArgR174.212.48 天冬酰氨(asparagine)AsnN132.1  天冬氨酸(aspartic acid)AspD133.13.86 半胱氨酸(systeine)CysC121.12  谷氨酰胺(glutamine)GlnQ146.15  谷氨酸(glutamic acid)GluE147.134.25 甘氨酸(glycine)GlyG75.07  组氨酸(histidine)HisH155.166.0 异亮氨酸(isoleucine)lleI131.17  亮氨酸(leucine)LeuL131.17  赖氨酸(lycine)LysK146.19  甲硫氨酸(methionine)MetM149.21  苯丙氨酸(phenylanaline)PheP165.19  脯氨酸(proline)ProP115.13  丝氨酸(serine)SerS105.06  苏氨酸(threonine)ThrT119.12  色氨酸(tryptophan)TrpW204.22  酪氨酸(tyrosine)TyrY181.1910.07 缬氨酸(valine)ValP117.15 

八、遗传密码

密码子的第二位

密码子的第一位(5’端) UCAG 密码子的第三位(3端’)UUUUPheUCUSerUAUTyrUGUGysUUUCPheUCCSerUACTyrUGGGysCUUALeuUCASerUAA终止(赭石)UGA终止(乳白)AUUGLeuUGGSerUAG终止(琥珀)UGGTrpGCCUULeuCCUProCAUHisCGAArgUCUCLeuCCCProCACHisCGCArgCCUALeuCCAProCAAGlnCGAArgACUGLeuCCGProCAGGlnCGCArgGAAUUIleACUThrAAUAsnAGUSerUAUCIleACCThrAACAsnAGCSerCAUAIleACAThrAAALysAGAArgAAUGMetACGThrAAGLysAGCArgGGGUUValGCUAlaGAUAspGGUGlyUGUCValGCCAlaGACAspGGCGlyCGUAValGCAAlaGAAGluGGAGlyAGUGValGCGAlaGAGGluGGGGlyG

九、常用酸碱技术参数

1.

溶质分子式分子量mol/Lg/L重量(%)比重配制mol/L溶液的加入量(ml/L)冰乙酸CH3COOH60.0517.40104599.51.05057.5乙酸 60.056.27376361.045159.5甲酸HCOOH46.0223.401080901.20042.7盐酸HCl36.5011.60424361.18086.2   2.90105101.050344.8硝酸HNO363.0215.991008711.42062.5   14.90938671.40067.1   13.30837611.37075.2高氯酸HclO3100.5011.651172701.67085.8   9.20923601.540108.7磷酸H2PO480.0018.101445851.70055.2硫酸H2P`O498.1018.001776961.84055.6氢氧化铵NH4OH35.0014.80251280.89867.6氢氧化钾KOH56.1013.50757501.52074.1   1.94109101.090515.5氢氧化钠NaOH40.0019.10763501.53052.4   2.75111101.110363.4

2.各种浓度的酸碱贮存液的近似pH值

溶质1Na0.1Na0.01Na0.001Na乙酸0.402.903.403.90盐酸0.101.072.023.01硫酸0.301.202.10 柠檬酸 2.102.60 氢氧化铵11.8011.3010.8010.30氢氧化钠14.0513.0712.1211.13碳酸氢钠 8.40  碳酸钠 11.5011.00 

J a.N为光量浓度[1N(1mol/L)×离子价数]。

十、放射性核素数据

1.放射性核素衰变

3H35S32P125I131I时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)194.5298.4195.3495.50.298.3289.3596.1290.8891.20.496.6384.41092.3386.51287.10.695.0479.81588.7482.51683.11.091.8575.42085.3578.52079.41.687.2671.32582.0674.82475.82.381.2767.43178.1771.22872.43.176.7863.73774.5867.83269.14.071.0960.24371.0964.73666.05.065.21056.95067.01061.24063.06.159.31153.85763.61158.74460.27.353.41250.96559.61255.94857.48.150.012.350.07356.01353.25254.8    8152.51450.75652.4    87.150.014.350.06050.0  

2.放射性测定单

单位定义换算吸收放射线剂量(拉得rad)100尔格/克(电离辐射传给单位质量物质的能量)0.87rad=1r伦琴(r)使1克空气产生1.6×1012离子对的X或γ-射线的照射剂量r/0.87=1rad居里(Ci)每秒放射性衰变3.7×1010个原子的量1Ci=103mCi=106μCi毫居(mCi)千分之一居里1mCi=10-3Ci=103μCi微居(μCi)百万分之一居里(每分钟衰变2.2×106次)1μCi=10-6Ci=10-3MCi伯克莱尔(Bq)每秒衰变1个原子的量1Bq=3.7×10-10Ci千伯克莱尔(kBq) 1kBq=103Bq百万伯克莱尔(MBq) 1MBq=106Bq兆伯克莱尔(GBq) 1GBq=109Bq每分钟衰变数(dpm)每分钟衰变的原子数2.2×106dpm=1μCi每分钟计数(cpm)测量仪测出每分钟β粒子数Cpm=dpm×计数器效率

十一、原子量

符号原子序数原子量锕(actinium)Ac89227.02铝(aluminium)Al1326.98镅(americium)Am95(243)锑(antimony)Sb51121.75氩(argon)Ar1839.94砷(arsenic)As3374.92砹(astatine)At85(210)钡(barium)Ba56137.33锫(berkelium)Bk97(247)铍(beryllium)Be49.01铋(bismuth)Bi83208.98硼(boron)B510.81溴(bromine)Br3579.90镉(cadmium)Cd48112.41钙(calcium)Ca2040.08锎(californium)Cf98(251)碳(carbon)C612.01铈(cerium)Ce58140.12铯(cesium)Cs55132.90氯(chlorine)Cl1735.45铬(chromium)Cr2451.99钴(cobalt)Co2758.93铜(copper)Cu2963.54锔(curium)Cm96(247)镝(dysprosium)Dy66162.50锿(einsteinium)Es99(252)铒(erbium)Er68167.26铕(euroqium)Eu63151.96镄(fermium)Fm100(257)氟(fluorine)F918.99钫(francium)Fr87(223)钆(gadolinium)Gd64157.52镓(galium)Ga3169.72锗(germanium)Ge3272.59金(gold)Au79196.96铪(hafnium)Hf72178.49氦(helium)He24.00钬(holmium)Ho67164.93氢(hydrogen)H11.00铟(indium)In49114.82碘(iodine)I53126.90铱(iridium)Ir77192.22铁(iron)Fe2655.84氪(krypton)Kr3683.80镧(lanthanum)La57139.90铹(Lawrencium)Lr103(260)铅(lead)Pb82207.2锂(lithium)Li36.94镥(lutetium)Lu71174.96镁(Magnesium)Mg1224.30锰(manganse)Mn2554.93钔(mendelevium)Md101(258)汞(molybdenum)Hg80200.59钼(molybdenum)Mo4295.94钕(neodymium)Nd60144.24氖(neon)Ne1020.17镎(neptunium)Np93237.04镍(nickel)Ni2858.69铌(niobium)Nb4192.00氮(nitrogen)N714.00锘(nobelium)No102(259)锇(osmium)Os76190.2氧(oxygen)O815.99钯(palladium)Pd46106.42磷(phosphorus)P1530.94铂(platium)Pt78195.08钚(piutonium)Pu94(244)钋(polonium)Po84(209)钾(potassium)K1939.09镨(praseodymium)Pr59140.90钜(promethium)Pm61(145)镤(protactinium)Pa91231.03镭(radium)Ra88226.02氡(radon)Rn86(222)铼(rhenium)Re75186.20铑(rhodium)Rh45102.90铷(rubidium)Rb3785.46钌(ruthenium)Ru44101.07钐(samarium)Sm62150.36钪(scandium)Sc2144.95硒(sillicon)Se3478.96硅(sillicon)Si1428.08银(sliver)Ag47107.86钠(sodium)Na1122.98锶(strontium)Sr3887.62硫(sulfur)S1632.06钽(tantalum)Ta73180.94锝(technetium)Tc43(98)碲(tellurium)Te52127.60铽(terbium)Tb65158.92铊(thallium)Tl81204.38钍(thorium)Th90232.03锡(tin)Sn50118.69铥(thulium)Tm69168.93钛(titanium)Ti2247.88钨(tungsten)W74183.85unhilhexium(Unh)106(263)unnilpentium(Unp)105(262)unnilquadium(Unq)104(261)unnilseptium(Uns)107(262)铀(uranium)U92238.02钒(vanadium)V2350.94氙(xenon)Xe54131.29镒(ytterbium)Yb70173.04钇(yttrium)Y3988.90锌(zinc)Zn3065.38锆(zirconium)Zn4091.22

圆括号中的数字是该元素最稳定的同位素的质量数。

(吴康)